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凝胶迁移或电泳迁移率实验


     凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。通常将纯化的蛋白或细胞粗提液和标记的DNA探针一同保温,在非变性的聚丙烯凝胶电涌上,分离复合物和非结合的探针,DNA-复合物比非结合的探针移动慢。常用实验手段有同位素32P法和非同位素法(化学发光法)。标记探针根据研究结合蛋白的不同,可以是双链或是单链。当检测如转录调控因子一类的DNA结合蛋白,可以纯化蛋白,粗蛋白或核细胞抽提液。竞争实验中采用含蛋白结合序列的DNA片段和寡聚糖核苷酸片段(特异)和其他非相关的片段(非特异性)来确定DNA结合蛋白的特异性。在竞争的特异性和非特异性片段的存在下,依据复合物的特点和强度来确定特异性结合。

实验步骤:


    1.探针的标记探针为含有与蛋白特异性结合的中心盒,大约20bp。


    2.非变性电泳


 (1)制备4%非变性胶


 (2)制备样品


 (3)电泳:预跑胶30-60min,100V,上样,跑胶,100V,30min左右


    3.转膜:将胶取下,放在大小相似的尼龙膜上,上下各加1层润湿的blotting paper , 放到半干转移装置上,100V,380mA , 转膜1H.


    4.紫外交联: 取出膜,在紫外交联仪中交联,999.9mJ,固定10min。


    5.洗膜



实验步骤:

 (1)将封闭液和4倍洗涤液置于37-50℃溶解。


 (2)用20ml封闭液封闭尼龙膜,温浴15min,摇船轻摇。


 (3)20ml封闭液中加入66.7ul Stabilized Streptavidin-Horseradish Peroxidase Conjugate(1:300稀释),配制成conjugate/blocking solution。


 (4)将膜从封闭液中取出,在conjugate/blocking solution中轻摇15min。


 (5)将4倍洗涤液用双蒸水稀释成1倍洗涤液。


 (6)将膜置于新的培养皿,用20ml1倍洗涤液冲洗。


 (7)用1倍洗涤液洗膜4次,每次5min,摇床轻摇。


 (8)在新培养皿中加入30ml Substrate Equilibration Buffer,将膜放入,温浴5min,摇床轻摇。


 (9)加入6mlLuminol/Enhancer Solution 和6ml Stable Peroxide Solution, 避光置于锡箔纸包好的烧杯中,摇匀,作为Substrate Working Solution。


 (10)将膜从Substrate Equilibration Buffer中取出,用滤纸尽量吸去液体,放入新的培养皿。


 (11)将Substrate Working Solution用枪慢慢加到膜上使液体尽量到达整张膜,静置5min。


 (12)取出膜,控制膜不能干燥。


 (13)用保鲜膜将膜包好,不能有气泡。


 (14)在暗室中,将膜放入曝光盒,用X-ray胶片压片,曝光。


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